La Universidad Nacional Intercultural de la Amazonía logró ubicarse en el puesto 37 del ranking de las 39 mejores universidades del Perú; sin embargo, recientemente la Contraloría General de la República halló graves deficiencias en el control de asistencia y permanencia de los docentes, lo que genera dudas sobre la calidad educativa que ofrece esta casa de estudios.
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El Informe N.º 014-2025-OCI/5450-SVC, elaborado por el Órgano de Control Institucional de la UNIA, determinó que los docentes registran su asistencia manualmente, firmando todos a la misma hora 7:00 a.m. sin registrar tardanzas, lo que evidencia posible manipulación en los registros y falta de control real sobre el cumplimiento de la jornada laboral
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Durante las visitas in situ realizadas entre el 18 y el 24 de septiembre de 2025, los auditores encontraron aulas vacías y docentes ausentes, pese a que figuraban como presentes en los registros.
En la Escuela de Educación Primaria Bilingüe, no se encontraban en sus aulas las docentes Zamara Ponce Bardales, Isabel Edmith Reyna Cárdenas y Lida Maribel Cosme Solano.
En Educación Inicial Bilingüe, se registró la ausencia de Maritza Soria Ramírez, mientras que en Ingeniería Agroforestal Acuícola, no se hallaron en aula los docentes a cargo de las secciones 07 y 09; y en Ingeniería Agroindustrial, las aulas 12 y 14 también estaban vacías durante la verificación.
Estos hallazgos confirman la falta de control efectivo y supervisión académica, y que la universidad no garantiza el cumplimiento de las horas de clase programadas.
Otro aspecto crítico identificado por la Contraloría es que el Reglamento de Control de Asistencia y Permanencia del Personal Docente data de setiembre de 2008, y solo contempla el turno de mañana (7:00 a 13:40 horas), sin considerar el turno tarde (13:00 a 18:50 horas).
Esta omisión impide fiscalizar la asistencia de los profesores que dictan clases vespertinas, lo que, según el informe, podría generar incumplimientos laborales y horas no trabajadas sin sanción.
La Contraloría concluye que los lineamientos vigentes no se han actualizado en 17 años, lo que demuestra una desconexión entre la gestión administrativa y la realidad académica actual de la universidad.
El informe fue notificado al rector Juan López Ruiz mediante Oficio N.º 000376-2025-CG/OC5450, el 29 de septiembre de 2025, otorgándole cinco días hábiles para presentar acciones preventivas y correctivas.
El órgano de control exhorta a la autoridad universitaria a modernizar el sistema de control docente, implementar medios electrónicos y garantizar la transparencia en el uso de recursos públicos, advirtiendo que la situación pone en riesgo la calidad del servicio educativo.